Штамм коронавируса Омикрон стал доминирующим, прочно и основательно потеснил штамм Дельта, после анализа сточных вод в канализации некоторых западных стран Европы и в США.

1,5 года пандемии научили, что наиболее точные методы верификации эпидемиологической информации — косвенные. От частоты поисковых запросов до более изощренных, вроде анализа сточных вод на следы РНК вируса.

🧪Анализ проб сточных вод — чувствительный инструмент мониторинга инфицирования населения определенным вирусом. К COVID-19 его начали применять в начале 2020 г. Часто по сточным водам его удавалось обнаружить в стране раньше, чем в анализах пациентов. Пробы показывают распространение того или иного штамма. Секвенирование генетического материала из образцов (в них не геном активных вирусов, а отдельные участки кода, которые выводятся из организма и попадают в канализацию) показывает доминирующий на территории вариант по характерным мутациям.

Во Флориде, где официально — 7 случаев заражения омикроном, анализ сточных вод показал, что омикрон составляет почти 100% генетического материала SARS-CoV-2. Дельта и ее варианты были найдены в следовых количествах. Хотя это указывает на то, что омикрон распространяется гораздо быстрее, чем предыдущие штаммы, новость скорее позитивная. Вот почему.

Преобладание омикрона в сточных водах во Флориде указывает на массовое инфицирование им населения. А уровень прироста случаев COVID-19 в штате находится на минимальном уровне: в среднем 3,2 тыс. в день за неделю, в то время как на пике, в августе 2021 г. среднее за 7 дней превышало 24,5 тыс. в день. Значит, абсолютное большинство переносит омикрон бессимптомно. Число госпитализированных во Флориде также в пределах обычных колебаний: с начала декабря оно выросло на 12%, но составляет 1,5 тыс. человек, в то время как еще в октябре — 5 тыс., а в августе 2021 г. превышало 17 тыс. Глава округа Ориндж, где производился забор проб, заявил, что госпитализированные инфицированы преимущественно дельтой.

То же касается других штатов. В Колорадо, где официально выявлено 5 случаев омикрона, он найден в образцах сточных вод очистных сооружений целого ряда округов. А показатели заболеваемости и госпитализации в Колорадо на спаде. В Техасе, занимающем 2 место по числу инфицированных омикроном (62), где он был найден и в сточных водах, заболеваемость и госпитализации так же, как и во Флориде, на спаде после волны в начале осени 2021 г.

Ковид-ньюсмейкеры не были бы собой, если бы не добавляли к таким новостям намек на временной промежуток между появлением штамма и началом массовых госпитализаций. Но уже понятно:

1️⃣ Омикрон не ноябрьский черт из южноафриканской табакерки, а штамм, давно распространявшийся в странах Запада (а возможно и не только). И панические ужесточения ноября-декабря безосновательны.

2️⃣ Омикрон распространялся в течение, как минимум, всей осени, (а, возможно, и предшествующих месяцев), практически не повлияв на уровень обращений в больницу и смертность, как это было с дельтой. Национальный институт инфекционных заболеваний ЮАР отмечает: текущие показатели — ⅓ от госпитализации и ⅛ от смертности в предыдущие волны. Похожая ситуация наблюдается и в других местах, где — исходя из данных вирусных остатков из сточных вод — омикрон доминирует.

ВИРУСНАЯ НАГРУЗКА

Источник